Agua: 

Isla Mujeres al estar localizada dentro del Mar Caribe cuenta con playas de una blanca y fina arena rodeadas de las cristalinas aguas que por las variaciones en la profundidad varían de colores generando contrastes y diversas  tonalidades de azules.  La presencia de arrecifes de coral permite que las aguas de sus playas se mantengan tranquilas y a su ves son hogar de una gran variedad de flora y fauna de la región. Entre las especies de mamíferos que se pueden encontrar están los maravillosos delfines.  En la superficie se pueden encontrar tres lagunas: la Laguna Conil,la  Laguna Chakmochuk y la Laguna Macax que se forman por la entrada del Mar Caribe. Por su reducido tamaño esta isla no cuenta con corrientes de ríos que pasen por su superficie, sin embargo se pueden encontrar algunos cenotes de agua dulce.   

Selva: 

La biodiversidad de esta región se caracteriza por un suelo plano sin relieves formado de piedra caliza. En donde se desarrolla vegetación de selva mediana y selva baja. También se pueden encontrar manglares alrededor del litoral.  La fauna que se puede admirar en esta región esta comprendida por especies de mamíferos, reptiles aves acuáticas y terrestres. Alrededor de 600 especies de aves habitan alrededor de las playas del Mar Caribe y la mayoría de ellas son migratorias. Así mismo en este mar Caribe existen 500 especies de reptiles de las cuales el 94% son endémicas. Hay más de 90 tipos de mamíferos entre los que destacan el delfín y el manatí.   El clima de esta región esta influenciado por su ubicación tropical que permite una oscilación en su temperatura entre los 21 y los 32C.   

Cultura:  

La isla esta consagrada a Ixchel la diosa maya del amor y la fertilidad  quien ere venerada en tiempos prehispánicos. En la punta sur de la isla hay vestigios de ruinas mayas en donde se encuentra un santuario dedicado a la diosa Ixcel.  En 1517 Francisco Hernández de Córdoba llego a lo que hoy conocemos como isla Mujeres y Cabo Catoche. A su llegada se vivió un enfrentamiento con los nativos lo cual forma parte de las batallas de la conquista. Esta lucha culmino con Francisco de Montejo en 1542. Las mujeres de esta región realizaban peregrinajes a la isla como un paso en su desarrollo a convertirse de niña a mujer. En la actualidad el peregrinaje sigue existiendo sin embargo la causa ahora esta en manos de amantes de la protección y preservación de la flora y fauna de la región.  Entre las construcciones históricas que hoy en día se pueden admirar destaca la zona conocida como “El Meco” en la parte continental y el Observatorio maya en la parte sur de la Isla. Los vestigios arqueológicos de la isla que aun se conservan describen la época colonial de lo que fue una hacienda pirata.